8月下旬，叶飞由北戴河回到厦门前线，此时，大、小金门，包括金门唯一的港口料罗湾和海面，完全被我军炮火封锁。切断了金门和台湾的海上通道。
9月7日，美军以美舰护航，组成一支海上大编队。美国军舰配置在海上编队左、右两侧护航，把蒋军舰只和运输船只夹在中间，美舰和蒋军舰只相距仅2海里，由台湾向金门开来。情况复杂化了，美军已经卷入，怎么办？打不打？叶飞立即请示毛泽东。毛泽东回答：“照打不误。”
叶飞又请示：“是不是连美舰一起打？”
毛泽东回答：“只打蒋舰，不打美舰。”
叶飞为了准确执行命令，又请示：“我们不打美舰，但如果美舰向我开火，我们是否还击？”
毛泽东明确回答：“没有命令不准还击。”
叶飞严格按照毛泽东的命令，这一下他就极为紧张了，因为要严格执行这一命令，只打蒋舰，不准打美舰，这很不好办。美舰和蒋舰相距仅2海里，如果哪一个炮群瞄准不确，稍有误差，就会打到美舰。至于如美舰向我开炮，我不予还击，这倒还比较好办。